RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576955.5

PHF23-212, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PHF23, Length 1,944 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-212ENST00000576955 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.87■■■■■ 6.37
PHF23-212ENST00000576955 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.96■■■■■ 5.27
PHF23-212ENST00000576955 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.07■■■■■ 4.97
PHF23-212ENST00000576955 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.41■■■■■ 4.86
PHF23-212ENST00000576955 ABCC9O60706 1549 aa45.37■■■■■ 4.85
PHF23-212ENST00000576955 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.32■■■■■ 4.85
PHF23-212ENST00000576955 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.93■■■■■ 4.78
PHF23-212ENST00000576955 NACADO15069 1562 aa44.69■■■■■ 4.74
PHF23-212ENST00000576955 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.61■■■■■ 4.73
PHF23-212ENST00000576955 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.34■■■■■ 4.69
PHF23-212ENST00000576955 SCRIBQ14160 1630 aa44.03■■■■■ 4.64
PHF23-212ENST00000576955 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.4■■■■■ 4.54
PHF23-212ENST00000576955 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.94■■■■■ 4.46
PHF23-212ENST00000576955 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
PHF23-212ENST00000576955 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.74■■■■■ 4.43
PHF23-212ENST00000576955 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.6■■■■■ 4.41
PHF23-212ENST00000576955 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.5■■■■■ 4.39
PHF23-212ENST00000576955 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
PHF23-212ENST00000576955 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.36■■■■■ 4.37
PHF23-212ENST00000576955 SMARCA4P51532 1647 aa42.22■■■■■ 4.35
PHF23-212ENST00000576955 WIZO95785 1651 aa42.02■■■■■ 4.32
PHF23-212ENST00000576955 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.72■■■■■ 4.27
PHF23-212ENST00000576955 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
PHF23-212ENST00000576955 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
PHF23-212ENST00000576955 SMARCA2P51531 1590 aa41.56■■■■■ 4.24
PHF23-212ENST00000576955 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.53■■■■■ 4.24
PHF23-212ENST00000576955 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.21
PHF23-212ENST00000576955 NCAPD3P42695 1498 aa41.22■■■■■ 4.19
PHF23-212ENST00000576955 HMGXB3Q12766 1538 aa41.17■■■■■ 4.18
PHF23-212ENST00000576955 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.15■■■■■ 4.18
PHF23-212ENST00000576955 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.09■■■■■ 4.17
PHF23-212ENST00000576955 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.99■■■■■ 4.15
PHF23-212ENST00000576955 TRIM41Q8WV44 630 aa40.38■■■■■ 4.05
PHF23-212ENST00000576955 CFTRP13569 1480 aa40.27■■■■■ 4.04
PHF23-212ENST00000576955 ABCC8Q09428 1581 aa40.23■■■■■ 4.03
PHF23-212ENST00000576955 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.15■■■■■ 4.02
PHF23-212ENST00000576955 PRDM2Q13029 1718 aa40.1■■■■■ 4.01
PHF23-212ENST00000576955 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.05■■■■■ 4
PHF23-212ENST00000576955 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.03■■■■■ 42e-6■■■■□ 22.3
PHF23-212ENST00000576955 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.87■■■■□ 3.97
PHF23-212ENST00000576955 SYNJ1O43426 1573 aa39.85■■■■□ 3.97
PHF23-212ENST00000576955 NESP48681 1621 aa39.78■■■■□ 3.96
PHF23-212ENST00000576955 TOP2BQ02880 1626 aa39.74■■■■□ 3.95
PHF23-212ENST00000576955 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.7■■■■□ 3.95
PHF23-212ENST00000576955 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.7■■■■□ 3.95
PHF23-212ENST00000576955 CUX1P39880 1505 aa39.62■■■■□ 3.93
PHF23-212ENST00000576955 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
PHF23-212ENST00000576955 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.56■■■■□ 3.92
PHF23-212ENST00000576955 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.48■■■■□ 3.91
PHF23-212ENST00000576955 SOGA1O94964 1423 aa39.45■■■■□ 3.91
PHF23-212ENST00000576955 EEA1Q15075 1411 aa39.44■■■■□ 3.9
PHF23-212ENST00000576955 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.39■■■■□ 3.9
PHF23-212ENST00000576955 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.35■■■■□ 3.89
PHF23-212ENST00000576955 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.35■■■■□ 3.89
PHF23-212ENST00000576955 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.29■■■■□ 3.88
PHF23-212ENST00000576955 TOPBP1Q92547 1522 aa39.26■■■■□ 3.87
PHF23-212ENST00000576955 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.22■■■■□ 3.87
PHF23-212ENST00000576955 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.19■■■■□ 3.86
PHF23-212ENST00000576955 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
PHF23-212ENST00000576955 KIF27Q86VH2 1401 aa39.05■■■■□ 3.84
PHF23-212ENST00000576955 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
PHF23-212ENST00000576955 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.04■■■■□ 3.84
PHF23-212ENST00000576955 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.99■■■■□ 3.83
PHF23-212ENST00000576955 ERCC6Q03468 1493 aa38.97■■■■□ 3.83
PHF23-212ENST00000576955 CUX2O14529 1486 aa38.95■■■■□ 3.83
PHF23-212ENST00000576955 KIF21BO75037 1637 aa38.91■■■■□ 3.82
PHF23-212ENST00000576955 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.9■■■■□ 3.82
PHF23-212ENST00000576955 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.9■■■■□ 3.82
PHF23-212ENST00000576955 GOLGA3Q08378 1498 aa38.87■■■■□ 3.81
PHF23-212ENST00000576955 WDR62O43379 1518 aa38.84■■■■□ 3.81
PHF23-212ENST00000576955 WDR97A6NE52 1622 aa38.78■■■■□ 3.8
PHF23-212ENST00000576955 PRXQ9BXM0 1461 aa38.73■■■■□ 3.79
PHF23-212ENST00000576955 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
PHF23-212ENST00000576955 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.71■■■■□ 3.79
PHF23-212ENST00000576955 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
PHF23-212ENST00000576955 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.69■■■■□ 3.78
PHF23-212ENST00000576955 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
PHF23-212ENST00000576955 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.67■■■■□ 3.78
PHF23-212ENST00000576955 IGF1RP08069 1367 aa38.67■■■■□ 3.78
PHF23-212ENST00000576955 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.59■■■■□ 3.77
PHF23-212ENST00000576955 IFT140Q96RY7 1462 aa38.55■■■■□ 3.76
PHF23-212ENST00000576955 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
PHF23-212ENST00000576955 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.51■■■■□ 3.76
PHF23-212ENST00000576955 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.5■■■■□ 3.75
PHF23-212ENST00000576955 CEP162Q5TB80 1403 aa38.48■■■■□ 3.75
PHF23-212ENST00000576955 CUL7Q14999 1698 aa38.46■■■■□ 3.75
PHF23-212ENST00000576955 PBRM1Q86U86 1689 aa38.32■■■■□ 3.73
PHF23-212ENST00000576955 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.31■■■■□ 3.725e-8■■■■□ 24.2
PHF23-212ENST00000576955 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
PHF23-212ENST00000576955 GRIN2BQ13224 1484 aa38.24■■■■□ 3.71
PHF23-212ENST00000576955 CLIP1P30622 1438 aa38.22■■■■□ 3.71
PHF23-212ENST00000576955 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
PHF23-212ENST00000576955 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.11■■■■□ 3.69
PHF23-212ENST00000576955 ADAMTS12P58397 1594 aa38.09■■■■□ 3.69
PHF23-212ENST00000576955 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
PHF23-212ENST00000576955 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.01■■■■□ 3.68
PHF23-212ENST00000576955 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.98■■■■□ 3.67
PHF23-212ENST00000576955 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
PHF23-212ENST00000576955 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.87■■■■□ 3.65
PHF23-212ENST00000576955 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms