Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9N7

LRRC57, Leucine-rich repeat-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC57Q8N9N7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC57Q8N9N7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC57Q8N9N7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC57Q8N9N7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC57Q8N9N7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms