Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL13AP3Q6NVV1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPL13AP3Q6NVV1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL13AP3Q6NVV1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms