Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EIF4EBP1Q13541 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EIF4EBP1Q13541 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF4EBP1Q13541 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF4EBP1Q13541 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF4EBP1Q13541 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF4EBP1Q13541 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF4EBP1Q13541 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF4EBP1Q13541 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF4EBP1Q13541 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF4EBP1Q13541 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF4EBP1Q13541 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF4EBP1Q13541 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF4EBP1Q13541 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EIF4EBP1Q13541 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms