Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4Y1P22090 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS4Y1P22090 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms