Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB4P21439 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCB4P21439 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCB4P21439 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms