Protein–RNA interactions for Protein: P02745

C1QA, Complement C1q subcomponent subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QAP02745 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QAP02745 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QAP02745 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QAP02745 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QAP02745 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QAP02745 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QAP02745 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QAP02745 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QAP02745 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QAP02745 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QAP02745 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QAP02745 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QAP02745 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QAP02745 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QAP02745 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QAP02745 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QAP02745 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QAP02745 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QAP02745 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QAP02745 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QAP02745 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QAP02745 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QAP02745 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QAP02745 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QAP02745 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QAP02745 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QAP02745 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QAP02745 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QAP02745 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QAP02745 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QAP02745 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QAP02745 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QAP02745 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QAP02745 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QAP02745 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QAP02745 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QAP02745 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QAP02745 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QAP02745 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QAP02745 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QAP02745 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QAP02745 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QAP02745 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QAP02745 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QAP02745 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QAP02745 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QAP02745 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QAP02745 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QAP02745 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QAP02745 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QAP02745 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QAP02745 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QAP02745 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QAP02745 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QAP02745 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QAP02745 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QAP02745 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QAP02745 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QAP02745 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QAP02745 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QAP02745 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QAP02745 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QAP02745 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QAP02745 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QAP02745 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QAP02745 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QAP02745 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QAP02745 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QAP02745 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QAP02745 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QAP02745 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QAP02745 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QAP02745 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QAP02745 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QAP02745 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QAP02745 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QAP02745 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QAP02745 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QAP02745 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QAP02745 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QAP02745 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QAP02745 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QAP02745 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QAP02745 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QAP02745 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QAP02745 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QAP02745 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QAP02745 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QAP02745 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QAP02745 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QAP02745 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1QAP02745 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QAP02745 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QAP02745 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QAP02745 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QAP02745 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QAP02745 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QAP02745 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QAP02745 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QAP02745 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms