Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACD1B0YJ81 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HACD1B0YJ81 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HACD1B0YJ81 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms