Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COX19Q49B96 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
COX19Q49B96 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX19Q49B96 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX19Q49B96 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COX19Q49B96 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX19Q49B96 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX19Q49B96 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX19Q49B96 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX19Q49B96 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COX19Q49B96 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms