Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE1CQ14123 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE1CQ14123 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE1CQ14123 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms