Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASA4O43374 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASA4O43374 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASA4O43374 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASA4O43374 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASA4O43374 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASA4O43374 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA4O43374 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA4O43374 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA4O43374 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA4O43374 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA4O43374 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA4O43374 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RASA4O43374 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA4O43374 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA4O43374 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA4O43374 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA4O43374 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA4O43374 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA4O43374 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA4O43374 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA4O43374 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA4O43374 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA4O43374 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA4O43374 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA4O43374 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA4O43374 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA4O43374 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA4O43374 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA4O43374 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA4O43374 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA4O43374 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA4O43374 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA4O43374 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA4O43374 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA4O43374 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA4O43374 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA4O43374 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA4O43374 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA4O43374 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA4O43374 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RASA4O43374 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASA4O43374 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASA4O43374 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASA4O43374 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASA4O43374 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASA4O43374 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASA4O43374 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASA4O43374 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASA4O43374 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASA4O43374 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RASA4O43374 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASA4O43374 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASA4O43374 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASA4O43374 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RASA4O43374 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASA4O43374 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASA4O43374 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASA4O43374 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASA4O43374 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASA4O43374 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASA4O43374 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASA4O43374 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RASA4O43374 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASA4O43374 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASA4O43374 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASA4O43374 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASA4O43374 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RASA4O43374 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASA4O43374 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASA4O43374 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASA4O43374 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASA4O43374 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASA4O43374 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASA4O43374 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASA4O43374 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASA4O43374 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASA4O43374 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASA4O43374 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4O43374 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4O43374 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4O43374 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4O43374 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4O43374 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4O43374 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4O43374 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4O43374 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASA4O43374 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASA4O43374 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASA4O43374 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASA4O43374 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASA4O43374 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASA4O43374 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASA4O43374 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASA4O43374 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASA4O43374 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASA4O43374 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASA4O43374 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASA4O43374 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASA4O43374 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms