Protein–RNA interactions for Protein: O00142

TK2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK2O00142 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TK2O00142 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TK2O00142 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TK2O00142 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TK2O00142 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TK2O00142 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TK2O00142 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TK2O00142 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TK2O00142 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TK2O00142 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TK2O00142 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TK2O00142 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TK2O00142 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TK2O00142 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TK2O00142 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TK2O00142 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TK2O00142 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TK2O00142 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TK2O00142 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TK2O00142 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TK2O00142 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TK2O00142 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TK2O00142 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TK2O00142 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TK2O00142 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TK2O00142 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TK2O00142 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TK2O00142 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TK2O00142 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TK2O00142 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TK2O00142 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TK2O00142 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TK2O00142 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TK2O00142 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TK2O00142 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TK2O00142 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TK2O00142 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TK2O00142 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TK2O00142 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TK2O00142 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TK2O00142 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TK2O00142 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TK2O00142 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TK2O00142 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TK2O00142 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TK2O00142 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TK2O00142 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TK2O00142 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TK2O00142 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TK2O00142 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TK2O00142 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TK2O00142 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TK2O00142 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TK2O00142 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TK2O00142 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TK2O00142 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TK2O00142 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TK2O00142 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TK2O00142 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TK2O00142 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TK2O00142 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TK2O00142 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TK2O00142 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TK2O00142 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TK2O00142 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TK2O00142 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TK2O00142 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TK2O00142 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TK2O00142 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TK2O00142 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TK2O00142 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TK2O00142 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TK2O00142 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TK2O00142 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TK2O00142 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TK2O00142 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TK2O00142 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TK2O00142 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TK2O00142 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TK2O00142 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TK2O00142 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TK2O00142 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TK2O00142 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TK2O00142 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TK2O00142 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TK2O00142 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TK2O00142 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TK2O00142 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TK2O00142 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TK2O00142 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TK2O00142 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TK2O00142 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TK2O00142 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TK2O00142 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TK2O00142 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TK2O00142 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TK2O00142 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TK2O00142 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TK2O00142 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TK2O00142 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms