Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKA2Q8WVK7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKA2Q8WVK7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms