Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q71RC1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q71RC1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q71RC1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q71RC1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q71RC1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q71RC1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q71RC1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q71RC1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q71RC1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q71RC1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q71RC1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q71RC1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q71RC1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q71RC1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q71RC1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q71RC1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q71RC1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q71RC1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q71RC1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q71RC1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q71RC1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q71RC1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q71RC1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q71RC1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q71RC1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q71RC1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q71RC1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q71RC1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q71RC1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q71RC1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q71RC1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q71RC1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q71RC1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q71RC1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q71RC1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q71RC1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q71RC1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q71RC1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q71RC1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q71RC1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q71RC1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q71RC1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q71RC1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q71RC1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q71RC1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q71RC1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q71RC1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q71RC1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q71RC1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q71RC1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q71RC1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q71RC1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q71RC1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q71RC1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q71RC1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q71RC1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q71RC1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q71RC1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q71RC1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q71RC1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q71RC1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q71RC1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q71RC1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q71RC1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q71RC1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q71RC1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q71RC1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q71RC1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q71RC1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q71RC1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q71RC1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q71RC1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q71RC1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q71RC1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q71RC1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q71RC1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q71RC1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q71RC1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q71RC1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q71RC1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q71RC1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q71RC1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q71RC1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q71RC1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q71RC1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q71RC1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q71RC1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q71RC1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q71RC1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q71RC1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q71RC1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q71RC1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q71RC1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q71RC1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q71RC1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q71RC1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Q71RC1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q71RC1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q71RC1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms