RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299468.11

PCMTD2-202, Transcript of protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PCMTD2, Length 1,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2-202ENST00000299468 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.49■■■■■ 6.79
PCMTD2-202ENST00000299468 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.48■■■■■ 5.83
PCMTD2-202ENST00000299468 ABCC9O60706 1549 aa51.34■■■■■ 5.81
PCMTD2-202ENST00000299468 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.89■■■■■ 5.42
PCMTD2-202ENST00000299468 NACADO15069 1562 aa48.6■■■■■ 5.37
PCMTD2-202ENST00000299468 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.38■■■■■ 5.34
PCMTD2-202ENST00000299468 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.06■■■■■ 5.28
PCMTD2-202ENST00000299468 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.99■■■■■ 5.27
PCMTD2-202ENST00000299468 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.9■■■■■ 5.26
PCMTD2-202ENST00000299468 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.83■■■■■ 5.256e-6■■□□□ 12
PCMTD2-202ENST00000299468 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.7■■■■■ 5.23
PCMTD2-202ENST00000299468 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.57■■■■■ 5.21
PCMTD2-202ENST00000299468 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.46■■■■■ 5.19
PCMTD2-202ENST00000299468 SCRIBQ14160 1630 aa46.97■■■■■ 5.11
PCMTD2-202ENST00000299468 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.81■■■■■ 5.08
PCMTD2-202ENST00000299468 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.39■■■■■ 5.02
PCMTD2-202ENST00000299468 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.33■■■■■ 5.01
PCMTD2-202ENST00000299468 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.2■■■■■ 4.99
PCMTD2-202ENST00000299468 NCAPD3P42695 1498 aa44.89■■■■■ 4.78
PCMTD2-202ENST00000299468 SMARCA4P51532 1647 aa44.82■■■■■ 4.77
PCMTD2-202ENST00000299468 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.8■■■■■ 4.76
PCMTD2-202ENST00000299468 SMARCA2P51531 1590 aa44.64■■■■■ 4.74
PCMTD2-202ENST00000299468 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.57■■■■■ 4.73
PCMTD2-202ENST00000299468 HMGXB3Q12766 1538 aa44.57■■■■■ 4.73
PCMTD2-202ENST00000299468 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.37■■■■■ 4.69
PCMTD2-202ENST00000299468 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
PCMTD2-202ENST00000299468 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.34■■■■■ 4.69
PCMTD2-202ENST00000299468 ERCC6Q03468 1493 aa44.25■■■■■ 4.67
PCMTD2-202ENST00000299468 NESP48681 1621 aa44.2■■■■■ 4.67
PCMTD2-202ENST00000299468 CUX2O14529 1486 aa44.1■■■■■ 4.65
PCMTD2-202ENST00000299468 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.89■■■■■ 4.62
PCMTD2-202ENST00000299468 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.83■■■■■ 4.61
PCMTD2-202ENST00000299468 WIZO95785 1651 aa43.82■■■■■ 4.61
PCMTD2-202ENST00000299468 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
PCMTD2-202ENST00000299468 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.62■■■■■ 4.57
PCMTD2-202ENST00000299468 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.54■■■■■ 4.56
PCMTD2-202ENST00000299468 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.53■■■■■ 4.56
PCMTD2-202ENST00000299468 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.47■■■■■ 4.55
PCMTD2-202ENST00000299468 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.23■■■■■ 4.51
PCMTD2-202ENST00000299468 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.19■■■■■ 4.51
PCMTD2-202ENST00000299468 WDR62O43379 1518 aa43.11■■■■■ 4.49
PCMTD2-202ENST00000299468 CFTRP13569 1480 aa43.08■■■■■ 4.49
PCMTD2-202ENST00000299468 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.05■■■■■ 4.48
PCMTD2-202ENST00000299468 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.05■■■■■ 4.48
PCMTD2-202ENST00000299468 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.76■■■■■ 4.44
PCMTD2-202ENST00000299468 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
PCMTD2-202ENST00000299468 PRDM2Q13029 1718 aa42.68■■■■■ 4.42
PCMTD2-202ENST00000299468 TOPBP1Q92547 1522 aa42.27■■■■■ 4.36
PCMTD2-202ENST00000299468 IFT140Q96RY7 1462 aa42.18■■■■■ 4.34
PCMTD2-202ENST00000299468 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.18■■■■■ 4.34
PCMTD2-202ENST00000299468 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.12■■■■■ 4.33
PCMTD2-202ENST00000299468 OSCARQ8IYS5 282 aa42.1■■■■■ 4.33
PCMTD2-202ENST00000299468 ABCC8Q09428 1581 aa42.1■■■■■ 4.33
PCMTD2-202ENST00000299468 TRIM41Q8WV44 630 aa42.05■■■■■ 4.32
PCMTD2-202ENST00000299468 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
PCMTD2-202ENST00000299468 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
PCMTD2-202ENST00000299468 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
PCMTD2-202ENST00000299468 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.79■■■■■ 4.282e-8■■□□□ 14.3
PCMTD2-202ENST00000299468 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.72■■■■■ 4.27
PCMTD2-202ENST00000299468 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
PCMTD2-202ENST00000299468 CUX1P39880 1505 aa41.64■■■■■ 4.26
PCMTD2-202ENST00000299468 SOGA1O94964 1423 aa41.63■■■■■ 4.26
PCMTD2-202ENST00000299468 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.63■■■■■ 4.26
PCMTD2-202ENST00000299468 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.63■■■■■ 4.26
PCMTD2-202ENST00000299468 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.63■■■■■ 4.26
PCMTD2-202ENST00000299468 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.62■■■■■ 4.25
PCMTD2-202ENST00000299468 CHD1O14646 1710 aa41.6■■■■■ 4.25
PCMTD2-202ENST00000299468 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
PCMTD2-202ENST00000299468 ARHGEF11O15085 1522 aa41.49■■■■■ 4.23
PCMTD2-202ENST00000299468 FBLN2P98095 1184 aa41.42■■■■■ 4.22
PCMTD2-202ENST00000299468 WDR97A6NE52 1622 aa41.4■■■■■ 4.22
PCMTD2-202ENST00000299468 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.36■■■■■ 4.21
PCMTD2-202ENST00000299468 GRIN2BQ13224 1484 aa41.24■■■■■ 4.19
PCMTD2-202ENST00000299468 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
PCMTD2-202ENST00000299468 PBRM1Q86U86 1689 aa41.15■■■■■ 4.18
PCMTD2-202ENST00000299468 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.14■■■■■ 4.18
PCMTD2-202ENST00000299468 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.14■■■■■ 4.18
PCMTD2-202ENST00000299468 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.13■■■■■ 4.17
PCMTD2-202ENST00000299468 ARAP1Q96P48 1450 aa41.13■■■■■ 4.17
PCMTD2-202ENST00000299468 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
PCMTD2-202ENST00000299468 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.12■■■■■ 4.17
PCMTD2-202ENST00000299468 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.1■■■■■ 4.17
PCMTD2-202ENST00000299468 SYNJ2O15056 1496 aa41.09■■■■■ 4.17
PCMTD2-202ENST00000299468 SYNJ1O43426 1573 aa41.04■■■■■ 4.16
PCMTD2-202ENST00000299468 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41■■■■■ 4.15
PCMTD2-202ENST00000299468 TOP2BQ02880 1626 aa40.99■■■■■ 4.15
PCMTD2-202ENST00000299468 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.97■■■■■ 4.15
PCMTD2-202ENST00000299468 ADAMTS12P58397 1594 aa40.77■■■■■ 4.12
PCMTD2-202ENST00000299468 GRIN2AQ12879 1464 aa40.73■■■■■ 4.11
PCMTD2-202ENST00000299468 CEP170Q5SW79 1584 aa40.63■■■■■ 4.09
PCMTD2-202ENST00000299468 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.61■■■■■ 4.09
PCMTD2-202ENST00000299468 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.61■■■■■ 4.09
PCMTD2-202ENST00000299468 NUP160Q12769 1436 aa40.6■■■■■ 4.09
PCMTD2-202ENST00000299468 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
PCMTD2-202ENST00000299468 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.55■■■■■ 4.08
PCMTD2-202ENST00000299468 SHROOM2Q13796 1616 aa40.42■■■■■ 4.06
PCMTD2-202ENST00000299468 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.19■■■■■ 4.02
PCMTD2-202ENST00000299468 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
PCMTD2-202ENST00000299468 IGF1RP08069 1367 aa40.17■■■■■ 4.02
PCMTD2-202ENST00000299468 JPH4Q96JJ6 628 aa40.15■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms