Protein–RNA interactions for Protein: Q01085

TIAL1, Nucleolysin TIAR, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIAL1Q01085 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.827e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 INPP5A-201ENST00000342652 832 ntTSL 59.72□□□□□ -0.857e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 FGFR1-234ENST00000530568 467 ntTSL 39.47□□□□□ -0.897e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 FGFR1-233ENST00000529552 688 ntTSL 48.51□□□□□ -1.057e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 FGFR1-240ENST00000533668 571 ntTSL 57.59□□□□□ -1.197e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.387e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.417e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 PSMA3-212ENST00000557290 730 ntTSL 25.33□□□□□ -1.567e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.717e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 PSMA3-204ENST00000553677 363 ntTSL 53.91□□□□□ -1.787e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 FGFR1-235ENST00000530701 276 ntTSL 1 (best)2.28□□□□□ -2.047e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 ATIC-207ENST00000443953 2187 ntTSL 220.25■□□□□ 0.835e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.685e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.435e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 ATIC-203ENST00000426233 713 ntTSL 25.88□□□□□ -1.475e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 ATIC-213ENST00000479093 772 ntTSL 25.82□□□□□ -1.485e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 ATIC-211ENST00000467388 714 ntTSL 24.65□□□□□ -1.675e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 ATIC-209ENST00000446622 615 ntTSL 34.54□□□□□ -1.685e-8■■■■■ 27.6
TIAL1Q01085 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 CCNL1-226ENST00000631619 2457 ntTSL 517.84■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 CCNL1-217ENST00000476367 1603 ntTSL 1 (best)14.16□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 CCNL1-212ENST00000470121 1889 ntTSL 1 (best)13.93□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 CCNL1-219ENST00000477127 1464 ntTSL 513.44□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 CCNL1-216ENST00000475298 2362 ntTSL 1 (best)12.81□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 CCNL1-206ENST00000464679 534 ntTSL 34.98□□□□□ -1.611e-7■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 CCNL1-215ENST00000474539 4799 ntTSL 1 (best)3.95□□□□□ -1.781e-7■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 CCNL1-204ENST00000464316 3843 ntTSL 1 (best)3.69□□□□□ -1.821e-7■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 CCNL1-221ENST00000479052 458 ntTSL 32.78□□□□□ -1.961e-7■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 CCNL1-214ENST00000471247 3671 ntTSL 1 (best)2.62□□□□□ -1.991e-7■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 SLC2A1-208ENST00000630287 2398 ntTSL 515.43■□□□□ 0.066e-9■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.56e-9■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 FN1-214ENST00000460217 804 ntTSL 210.55□□□□□ -0.722e-19■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 FN1-215ENST00000461974 571 ntTSL 24.74□□□□□ -1.652e-19■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 FN1-222ENST00000485567 584 ntTSL 1 (best)4.74□□□□□ -1.652e-19■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 RPS3A-209ENST00000510993 762 ntTSL 512.08□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 RPS3A-206ENST00000507485 1526 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 RPS3A-214ENST00000515818 572 ntTSL 55.85□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.571e-6■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 RPS3A-211ENST00000512797 686 ntTSL 25.17□□□□□ -1.581e-6■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.771e-6■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 RPS3A-213ENST00000515792 671 ntTSL 34.02□□□□□ -1.771e-6■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 RPS3A-205ENST00000507327 674 ntTSL 23.21□□□□□ -1.91e-6■■■■■ 27.5
TIAL1Q01085 NDUFS4-203ENST00000506765 559 ntTSL 210.74□□□□□ -0.694e-8■■■■■ 27.4
TIAL1Q01085 NDUFS4-204ENST00000506974 833 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.834e-8■■■■■ 27.4
TIAL1Q01085 NDUFS4-201ENST00000296684 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.894e-8■■■■■ 27.4
TIAL1Q01085 NDUFS4-202ENST00000502423 562 ntTSL 59.14□□□□□ -0.954e-8■■■■■ 27.4
TIAL1Q01085 NDUFS4-205ENST00000507026 680 ntTSL 38.01□□□□□ -1.134e-8■■■■■ 27.4
TIAL1Q01085 IGF2BP2-206ENST00000464166 380 ntTSL 34.51□□□□□ -1.699e-16■■■■■ 27.4
TIAL1Q01085 ENC1-203ENST00000509127 584 ntTSL 319.5■□□□□ 0.711e-10■■■■■ 27.3
TIAL1Q01085 ENC1-202ENST00000508331 1405 ntTSL 419.28■□□□□ 0.681e-10■■■■■ 27.3
TIAL1Q01085 ENC1-206ENST00000537006 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.381e-10■■■■■ 27.3
TIAL1Q01085 TMCC1-201ENST00000393238 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 27.3
TIAL1Q01085 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 27.3
TIAL1Q01085 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 27.3
TIAL1Q01085 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 27.3
TIAL1Q01085 MAGI1-207ENST00000470990 2138 ntTSL 1 (best)8.08□□□□□ -1.122e-8■■■■■ 27.2
TIAL1Q01085 RRBP1-209ENST00000495501 832 ntTSL 519.33■□□□□ 0.688e-8■■■■■ 27.2
TIAL1Q01085 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.548e-8■■■■■ 27.2
TIAL1Q01085 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.578e-8■■■■■ 27.2
TIAL1Q01085 TCERG1-202ENST00000394421 3633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 TCERG1-216ENST00000549332 3518 ntTSL 510.74□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 TCERG1-201ENST00000296702 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 TCERG1-215ENST00000515203 576 ntTSL 56.6□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 TCERG1-206ENST00000506524 3787 ntTSL 1 (best)5.77□□□□□ -1.491e-7■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.868e-7■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 HNF4A-203ENST00000372920 3340 ntTSL 1 (best)18.01■□□□□ 0.478e-7■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.48e-7■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 HNF4A-207ENST00000609262 540 ntTSL 1 (best)16.73■□□□□ 0.278e-7■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.388e-7■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.488e-7■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 HNF4A-201ENST00000316099 6445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.88e-7■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 HNF4A-209ENST00000619550 4763 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.88e-7■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 NCL-207ENST00000461347 3967 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 NCL-210ENST00000494618 910 ntTSL 26.26□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 27.1
TIAL1Q01085 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 27
TIAL1Q01085 APBB2-214ENST00000508593 3592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 27
TIAL1Q01085 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.965e-7■■■■■ 27
TIAL1Q01085 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.075e-7■■■■■ 27
TIAL1Q01085 ARHGEF16-205ENST00000445297 836 ntTSL 322.7■■□□□ 1.228e-8■■■■■ 27
TIAL1Q01085 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.228e-8■■■■■ 27
TIAL1Q01085 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.23e-8■■■■■ 27
TIAL1Q01085 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.028e-8■■■■■ 27
TIAL1Q01085 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.028e-8■■■■■ 27
TIAL1Q01085 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.63e-8■■■■■ 27
TIAL1Q01085 PIK3C2A-203ENST00000531428 1593 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.16e-8■■■■■ 27
TIAL1Q01085 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.56e-8■■■■■ 27
TIAL1Q01085 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.246e-7■■■■■ 27
TIAL1Q01085 HECTD1-213ENST00000556224 3267 ntTSL 513.53□□□□□ -0.249e-7■■■■■ 26.9
TIAL1Q01085 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 26.9
TIAL1Q01085 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 25.78□□□□□ -1.481e-6■■■■■ 26.9
TIAL1Q01085 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 23.73□□□□□ -1.811e-6■■■■■ 26.9
TIAL1Q01085 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 26.9
TIAL1Q01085 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.72e-14■■■■■ 26.9
TIAL1Q01085 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.712e-14■■■■■ 26.9
TIAL1Q01085 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 26.8
Retrieved 100 of 8,119 protein–RNA pairs in 267.8 ms