Protein–RNA interactions for Protein: Q01085

TIAL1, Nucleolysin TIAR, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIAL1Q01085 ANKRD10-203ENST00000460846 535 ntTSL 312.22□□□□□ -0.452e-31■■■■■ 123.3
TIAL1Q01085 ANKRD10-204ENST00000463156 395 ntTSL 37.76□□□□□ -1.172e-31■■■■■ 123.3
TIAL1Q01085 ANKRD10-205ENST00000464579 128 ntTSL 33.48□□□□□ -1.852e-31■■■■■ 123.3
TIAL1Q01085 SF3B1-208ENST00000470268 2003 ntTSL 24.65□□□□□ -1.662e-12■■■■■ 96.5
TIAL1Q01085 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.562e-36■■■■■ 91.6
TIAL1Q01085 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.52e-36■■■■■ 91.6
TIAL1Q01085 STX16-NPEPL1-201ENST00000413559 557 ntTSL 37.58□□□□□ -1.22e-36■■■■■ 91.6
TIAL1Q01085 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.349e-27■■■■■ 91.4
TIAL1Q01085 PCNA-201ENST00000379143 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.559e-27■■■■■ 91.4
TIAL1Q01085 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.141e-24■■■■■ 84.3
TIAL1Q01085 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.231e-24■■■■■ 84.3
TIAL1Q01085 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 212.01□□□□□ -0.491e-24■■■■■ 84.3
TIAL1Q01085 TNS3-205ENST00000434451 560 ntTSL 515.86■□□□□ 0.135e-9■■■■■ 82.3
TIAL1Q01085 TNS3-207ENST00000450444 1832 ntTSL 512.95□□□□□ -0.345e-9■■■■■ 82.3
TIAL1Q01085 TNS3-203ENST00000415929 570 ntTSL 411.83□□□□□ -0.525e-9■■■■■ 82.3
TIAL1Q01085 TNS3-206ENST00000442536 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.765e-9■■■■■ 82.3
TIAL1Q01085 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.475e-9■■■■■ 82.3
TIAL1Q01085 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-11■■■■■ 81.6
TIAL1Q01085 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.481e-11■■■■■ 81.6
TIAL1Q01085 MCM4-212ENST00000521151 1125 ntTSL 28.05□□□□□ -1.121e-11■■■■■ 81.6
TIAL1Q01085 EIF4G1-233ENST00000475721 1271 ntTSL 218.99■□□□□ 0.635e-16■■■■■ 77.3
TIAL1Q01085 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.015e-16■■■■■ 77.3
TIAL1Q01085 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.085e-16■■■■■ 77.3
TIAL1Q01085 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.145e-16■■■■■ 77.3
TIAL1Q01085 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.155e-16■■■■■ 77.3
TIAL1Q01085 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.185e-16■■■■■ 77.3
TIAL1Q01085 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.265e-16■■■■■ 77.3
TIAL1Q01085 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.275e-16■■■■■ 77.3
TIAL1Q01085 EIF4G1-222ENST00000442406 5129 ntTSL 1 (best)13.09□□□□□ -0.315e-16■■■■■ 77.3
TIAL1Q01085 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.355e-16■■■■■ 77.3
TIAL1Q01085 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.455e-16■■■■■ 77.3
TIAL1Q01085 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.366e-21■■■■■ 72.9
TIAL1Q01085 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.527e-18■■■■■ 72.4
TIAL1Q01085 ANKRD10-210ENST00000494859 705 ntTSL 528.18■■■□□ 2.14e-7■■■■■ 70.7
TIAL1Q01085 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 70.7
TIAL1Q01085 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 70.7
TIAL1Q01085 ANKRD10-206ENST00000465753 997 ntTSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 70.7
TIAL1Q01085 ANKRD10-209ENST00000489973 745 ntTSL 38.63□□□□□ -1.034e-7■■■■■ 70.7
TIAL1Q01085 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 68.7
TIAL1Q01085 BAG6-257ENST00000462875 972 ntTSL 217.05■□□□□ 0.324e-19■■■■■ 63.4
TIAL1Q01085 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.54e-19■■■■■ 63.4
TIAL1Q01085 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.514e-19■■■■■ 63.4
TIAL1Q01085 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.584e-19■■■■■ 63.4
TIAL1Q01085 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.614e-19■■■■■ 63.4
TIAL1Q01085 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.674e-19■■■■■ 63.4
TIAL1Q01085 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 62.8
TIAL1Q01085 SF3B1-211ENST00000487698 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 62.8
TIAL1Q01085 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.41e-7■■■■■ 62.8
TIAL1Q01085 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.721e-7■■■■■ 62.8
TIAL1Q01085 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.079e-11■■■■■ 59.7
TIAL1Q01085 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.359e-11■■■■■ 59.7
TIAL1Q01085 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.259e-11■■■■■ 59.7
TIAL1Q01085 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.019e-11■■■■■ 59.7
TIAL1Q01085 TNS3-208ENST00000457718 3836 ntTSL 510.48□□□□□ -0.736e-9■■■■■ 59.1
TIAL1Q01085 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.866e-9■■■■■ 59.1
TIAL1Q01085 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.159e-32■■■■■ 58.8
TIAL1Q01085 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.399e-32■■■■■ 58.8
TIAL1Q01085 SHANK2-215ENST00000470759 762 ntTSL 518.18■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 58.4
TIAL1Q01085 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 58.4
TIAL1Q01085 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 58.4
TIAL1Q01085 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 58.4
TIAL1Q01085 SHANK2-209ENST00000445654 522 ntTSL 312.65□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 58.4
TIAL1Q01085 SHANK2-205ENST00000412252 1376 ntTSL 511.65□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 58.4
TIAL1Q01085 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.675e-7■■■■■ 58.4
TIAL1Q01085 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.725e-7■■■■■ 58.4
TIAL1Q01085 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 58.4
TIAL1Q01085 SHANK2-208ENST00000426687 460 ntTSL 58.31□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 58.4
TIAL1Q01085 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.86e-17■■■■■ 58.1
TIAL1Q01085 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.916e-17■■■■■ 58.1
TIAL1Q01085 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.986e-17■■■■■ 58.1
TIAL1Q01085 MAGI3-206ENST00000486456 897 ntTSL 519.23■□□□□ 0.676e-15■■■■■ 57.9
TIAL1Q01085 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.036e-15■■■■■ 57.9
TIAL1Q01085 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.026e-15■■■■■ 57.9
TIAL1Q01085 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.096e-15■■■■■ 57.9
TIAL1Q01085 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.196e-15■■■■■ 57.9
TIAL1Q01085 MAGI3-205ENST00000477955 890 ntTSL 36.51□□□□□ -1.376e-15■■■■■ 57.9
TIAL1Q01085 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.234e-16■■■■■ 55.2
TIAL1Q01085 CYB5A-201ENST00000299438 718 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.634e-16■■■■■ 55.2
TIAL1Q01085 CYB5A-207ENST00000583418 5913 ntTSL 28.76□□□□□ -1.014e-16■■■■■ 55.2
TIAL1Q01085 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.284e-16■■■■■ 55.2
TIAL1Q01085 CYB5A-206ENST00000580678 1173 ntTSL 1 (best)6.63□□□□□ -1.354e-16■■■■■ 55.2
TIAL1Q01085 SAMD5-202ENST00000566741 393 ntTSL 34.9□□□□□ -1.638e-16■■■■■ 54.3
TIAL1Q01085 AL033504.1-202ENST00000432506 406 ntTSL 22.82□□□□□ -1.968e-16■■■■■ 54.3
TIAL1Q01085 MANF-202ENST00000470900 1509 ntTSL 224.77■■□□□ 1.561e-11■■■■■ 53.9
TIAL1Q01085 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.341e-11■■■■■ 53.9
TIAL1Q01085 MANF-201ENST00000446668 846 ntTSL 319.78■□□□□ 0.761e-11■■■■■ 53.9
TIAL1Q01085 NUP35-209ENST00000479162 2828 ntTSL 28.95□□□□□ -0.989e-16■■■■■ 53.3
TIAL1Q01085 NUP35-202ENST00000374930 998 ntTSL 27.62□□□□□ -1.199e-16■■■■■ 53.3
TIAL1Q01085 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.79e-16■■■■■ 53.3
TIAL1Q01085 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.749e-16■■■■■ 53.3
TIAL1Q01085 MGST1-213ENST00000539036 566 ntTSL 410.41□□□□□ -0.744e-12■■■■■ 51.9
TIAL1Q01085 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.84e-12■■■■■ 51.9
TIAL1Q01085 MGST1-217ENST00000542256 933 ntTSL 1 (best)9.51□□□□□ -0.894e-12■■■■■ 51.9
TIAL1Q01085 MGST1-219ENST00000624056 1842 nt8.03□□□□□ -1.124e-12■■■■■ 51.9
TIAL1Q01085 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.344e-12■■■■■ 51.9
TIAL1Q01085 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.54e-12■■■■■ 51.9
TIAL1Q01085 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.54e-12■■■■■ 51.9
TIAL1Q01085 MGST1-208ENST00000535624 655 ntTSL 25.62□□□□□ -1.514e-12■■■■■ 51.9
TIAL1Q01085 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.74e-12■■■■■ 51.9
TIAL1Q01085 MGST1-211ENST00000538857 535 ntTSL 33.98□□□□□ -1.774e-12■■■■■ 51.9
Retrieved 100 of 8,119 protein–RNA pairs in 36.4 ms