Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK3P51956 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK3P51956 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK3P51956 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK3P51956 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK3P51956 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK3P51956 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK3P51956 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK3P51956 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK3P51956 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK3P51956 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK3P51956 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK3P51956 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK3P51956 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK3P51956 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK3P51956 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK3P51956 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK3P51956 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK3P51956 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK3P51956 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK3P51956 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK3P51956 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK3P51956 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK3P51956 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK3P51956 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK3P51956 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK3P51956 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK3P51956 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK3P51956 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK3P51956 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK3P51956 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK3P51956 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK3P51956 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK3P51956 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK3P51956 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK3P51956 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK3P51956 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK3P51956 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK3P51956 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK3P51956 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK3P51956 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK3P51956 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK3P51956 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK3P51956 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK3P51956 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK3P51956 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK3P51956 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK3P51956 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK3P51956 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK3P51956 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK3P51956 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK3P51956 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK3P51956 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK3P51956 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK3P51956 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK3P51956 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK3P51956 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK3P51956 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK3P51956 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK3P51956 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK3P51956 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK3P51956 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEK3P51956 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK3P51956 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK3P51956 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK3P51956 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK3P51956 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK3P51956 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK3P51956 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK3P51956 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK3P51956 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK3P51956 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK3P51956 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK3P51956 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK3P51956 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK3P51956 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK3P51956 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK3P51956 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK3P51956 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK3P51956 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK3P51956 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK3P51956 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK3P51956 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK3P51956 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK3P51956 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK3P51956 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK3P51956 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK3P51956 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK3P51956 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK3P51956 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK3P51956 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK3P51956 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEK3P51956 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEK3P51956 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEK3P51956 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK3P51956 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK3P51956 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK3P51956 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK3P51956 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK3P51956 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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