Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F7

CDY2A, Testis-specific chromodomain protein Y 2, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY2AQ9Y6F7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDY2AQ9Y6F7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDY2AQ9Y6F7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDY2AQ9Y6F7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDY2AQ9Y6F7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDY2AQ9Y6F7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDY2AQ9Y6F7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CDY2AQ9Y6F7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDY2AQ9Y6F7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDY2AQ9Y6F7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDY2AQ9Y6F7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDY2AQ9Y6F7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDY2AQ9Y6F7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDY2AQ9Y6F7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDY2AQ9Y6F7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDY2AQ9Y6F7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDY2AQ9Y6F7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms