Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF6Q9Y252 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF6Q9Y252 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms