Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCML1Q9UN30 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCML1Q9UN30 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCML1Q9UN30 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms