Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXC10Q9NYD6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXC10Q9NYD6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXC10Q9NYD6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms