Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMC2Q9NRP2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMC2Q9NRP2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMC2Q9NRP2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms