Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAC7

SUGCT, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGCTQ9HAC7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUGCTQ9HAC7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUGCTQ9HAC7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SUGCTQ9HAC7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SUGCTQ9HAC7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUGCTQ9HAC7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms