Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAC7

SUGCT, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGCTQ9HAC7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SUGCTQ9HAC7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SUGCTQ9HAC7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SUGCTQ9HAC7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SUGCTQ9HAC7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SUGCTQ9HAC7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SUGCTQ9HAC7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
SUGCTQ9HAC7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SUGCTQ9HAC7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUGCTQ9HAC7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SUGCTQ9HAC7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SUGCTQ9HAC7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SUGCTQ9HAC7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SUGCTQ9HAC7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SUGCTQ9HAC7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SUGCTQ9HAC7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SUGCTQ9HAC7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SUGCTQ9HAC7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SUGCTQ9HAC7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SUGCTQ9HAC7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SUGCTQ9HAC7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SUGCTQ9HAC7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SUGCTQ9HAC7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SUGCTQ9HAC7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SUGCTQ9HAC7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SUGCTQ9HAC7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SUGCTQ9HAC7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SUGCTQ9HAC7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SUGCTQ9HAC7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SUGCTQ9HAC7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SUGCTQ9HAC7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SUGCTQ9HAC7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SUGCTQ9HAC7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SUGCTQ9HAC7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SUGCTQ9HAC7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SUGCTQ9HAC7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SUGCTQ9HAC7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SUGCTQ9HAC7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SUGCTQ9HAC7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SUGCTQ9HAC7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUGCTQ9HAC7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SUGCTQ9HAC7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SUGCTQ9HAC7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUGCTQ9HAC7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SUGCTQ9HAC7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SUGCTQ9HAC7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SUGCTQ9HAC7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SUGCTQ9HAC7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SUGCTQ9HAC7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUGCTQ9HAC7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUGCTQ9HAC7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUGCTQ9HAC7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUGCTQ9HAC7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SUGCTQ9HAC7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SUGCTQ9HAC7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SUGCTQ9HAC7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SUGCTQ9HAC7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SUGCTQ9HAC7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SUGCTQ9HAC7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SUGCTQ9HAC7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SUGCTQ9HAC7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SUGCTQ9HAC7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SUGCTQ9HAC7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SUGCTQ9HAC7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SUGCTQ9HAC7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SUGCTQ9HAC7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SUGCTQ9HAC7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SUGCTQ9HAC7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SUGCTQ9HAC7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SUGCTQ9HAC7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SUGCTQ9HAC7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SUGCTQ9HAC7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SUGCTQ9HAC7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SUGCTQ9HAC7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SUGCTQ9HAC7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SUGCTQ9HAC7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SUGCTQ9HAC7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SUGCTQ9HAC7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SUGCTQ9HAC7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SUGCTQ9HAC7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SUGCTQ9HAC7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SUGCTQ9HAC7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SUGCTQ9HAC7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SUGCTQ9HAC7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SUGCTQ9HAC7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SUGCTQ9HAC7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SUGCTQ9HAC7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SUGCTQ9HAC7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SUGCTQ9HAC7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SUGCTQ9HAC7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SUGCTQ9HAC7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SUGCTQ9HAC7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SUGCTQ9HAC7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SUGCTQ9HAC7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SUGCTQ9HAC7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SUGCTQ9HAC7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SUGCTQ9HAC7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SUGCTQ9HAC7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SUGCTQ9HAC7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SUGCTQ9HAC7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms