Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB39BQ96DA2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB39BQ96DA2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB39BQ96DA2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB39BQ96DA2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms