Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4AQ8WYN0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4AQ8WYN0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms