Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NINQ8N4C6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINQ8N4C6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NINQ8N4C6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms