Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC43Q8N309 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC43Q8N309 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC43Q8N309 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC43Q8N309 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC43Q8N309 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms