Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD35Q8N283 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD35Q8N283 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD35Q8N283 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ANKRD35Q8N283 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms