Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDE2Q6IQ49 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDE2Q6IQ49 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDE2Q6IQ49 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms