Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y7H0

HLA-DQA1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA1Q5Y7H0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DQA1Q5Y7H0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DQA1Q5Y7H0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DQA1Q5Y7H0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DQA1Q5Y7H0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DQA1Q5Y7H0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DQA1Q5Y7H0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DQA1Q5Y7H0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-DQA1Q5Y7H0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms