Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y7H0

HLA-DQA1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA1Q5Y7H0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
HLA-DQA1Q5Y7H0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
HLA-DQA1Q5Y7H0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HLA-DQA1Q5Y7H0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HLA-DQA1Q5Y7H0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HLA-DQA1Q5Y7H0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HLA-DQA1Q5Y7H0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HLA-DQA1Q5Y7H0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HLA-DQA1Q5Y7H0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HLA-DQA1Q5Y7H0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HLA-DQA1Q5Y7H0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HLA-DQA1Q5Y7H0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HLA-DQA1Q5Y7H0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HLA-DQA1Q5Y7H0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HLA-DQA1Q5Y7H0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HLA-DQA1Q5Y7H0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HLA-DQA1Q5Y7H0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HLA-DQA1Q5Y7H0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DQA1Q5Y7H0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DQA1Q5Y7H0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DQA1Q5Y7H0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DQA1Q5Y7H0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DQA1Q5Y7H0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DQA1Q5Y7H0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DQA1Q5Y7H0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DQA1Q5Y7H0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DQA1Q5Y7H0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-DQA1Q5Y7H0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-DQA1Q5Y7H0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HLA-DQA1Q5Y7H0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HLA-DQA1Q5Y7H0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DQA1Q5Y7H0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DQA1Q5Y7H0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HLA-DQA1Q5Y7H0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HLA-DQA1Q5Y7H0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-DQA1Q5Y7H0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-DQA1Q5Y7H0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-DQA1Q5Y7H0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HLA-DQA1Q5Y7H0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HLA-DQA1Q5Y7H0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HLA-DQA1Q5Y7H0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-DQA1Q5Y7H0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-DQA1Q5Y7H0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HLA-DQA1Q5Y7H0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-DQA1Q5Y7H0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-DQA1Q5Y7H0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DQA1Q5Y7H0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DQA1Q5Y7H0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLA-DQA1Q5Y7H0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DQA1Q5Y7H0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DQA1Q5Y7H0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DQA1Q5Y7H0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DQA1Q5Y7H0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DQA1Q5Y7H0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DQA1Q5Y7H0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DQA1Q5Y7H0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HLA-DQA1Q5Y7H0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DQA1Q5Y7H0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms