Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF19Q5T6S3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF19Q5T6S3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHF19Q5T6S3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms