Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAT3Q53EU6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPAT3Q53EU6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPAT3Q53EU6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms