Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIK5Q16478 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GRIK5Q16478 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIK5Q16478 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIK5Q16478 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
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