Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APBA1Q02410 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APBA1Q02410 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
APBA1Q02410 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms