Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTN2Q02246 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTN2Q02246 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTN2Q02246 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms