Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHB3P54753 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EPHB3P54753 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB3P54753 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms