Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGER1P34995 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER1P34995 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGER1P34995 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms