Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC12P31275 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXC12P31275 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms