Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
JAK1P23458 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
JAK1P23458 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAK1P23458 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAK1P23458 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAK1P23458 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAK1P23458 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAK1P23458 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAK1P23458 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAK1P23458 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JAK1P23458 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JAK1P23458 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
JAK1P23458 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
JAK1P23458 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JAK1P23458 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JAK1P23458 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JAK1P23458 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JAK1P23458 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JAK1P23458 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
JAK1P23458 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JAK1P23458 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JAK1P23458 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
JAK1P23458 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JAK1P23458 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JAK1P23458 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAK1P23458 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAK1P23458 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAK1P23458 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAK1P23458 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAK1P23458 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAK1P23458 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
JAK1P23458 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
JAK1P23458 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
JAK1P23458 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JAK1P23458 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JAK1P23458 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JAK1P23458 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
JAK1P23458 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
JAK1P23458 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
JAK1P23458 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JAK1P23458 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAK1P23458 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAK1P23458 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAK1P23458 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAK1P23458 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAK1P23458 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAK1P23458 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAK1P23458 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
JAK1P23458 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
JAK1P23458 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
JAK1P23458 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
JAK1P23458 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
JAK1P23458 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
JAK1P23458 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JAK1P23458 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JAK1P23458 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JAK1P23458 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JAK1P23458 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
JAK1P23458 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
JAK1P23458 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
JAK1P23458 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
JAK1P23458 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
JAK1P23458 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAK1P23458 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
JAK1P23458 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
JAK1P23458 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
JAK1P23458 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
JAK1P23458 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
JAK1P23458 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
JAK1P23458 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
JAK1P23458 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
JAK1P23458 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
JAK1P23458 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
JAK1P23458 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
JAK1P23458 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
JAK1P23458 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
JAK1P23458 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
JAK1P23458 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
JAK1P23458 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
JAK1P23458 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
JAK1P23458 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
JAK1P23458 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
JAK1P23458 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
JAK1P23458 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
JAK1P23458 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
JAK1P23458 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
JAK1P23458 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
JAK1P23458 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JAK1P23458 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms