Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM4AO75164 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM4AO75164 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM4AO75164 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms