Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOBPA7XYQ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SOBPA7XYQ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms