Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWA8A3KMH1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA8A3KMH1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms