Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQF6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQF6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A1W2PQF6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PQF6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PQF6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1W2PQF6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A1W2PQF6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A1W2PQF6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PQF6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PQF6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PQF6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PQF6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PQF6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms