Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
U3KQE9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U3KQE9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U3KQE9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
U3KQE9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KQE9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KQE9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KQE9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KQE9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KQE9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KQE9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KQE9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
U3KQE9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
U3KQE9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KQE9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KQE9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KQE9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KQE9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KQE9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KQE9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U3KQE9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19■□□□□ 0.63
U3KQE9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U3KQE9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U3KQE9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
U3KQE9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
U3KQE9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
U3KQE9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
U3KQE9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
U3KQE9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
U3KQE9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
U3KQE9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
U3KQE9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
U3KQE9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
U3KQE9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
U3KQE9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
U3KQE9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
U3KQE9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
U3KQE9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
U3KQE9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
U3KQE9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
U3KQE9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
U3KQE9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
U3KQE9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
U3KQE9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
U3KQE9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U3KQE9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U3KQE9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
U3KQE9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
U3KQE9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
U3KQE9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
U3KQE9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U3KQE9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U3KQE9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KQE9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KQE9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KQE9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KQE9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KQE9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KQE9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KQE9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KQE9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KQE9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KQE9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KQE9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KQE9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KQE9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
U3KQE9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
U3KQE9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
U3KQE9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
U3KQE9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
U3KQE9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
U3KQE9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
U3KQE9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U3KQE9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U3KQE9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
U3KQE9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
U3KQE9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
U3KQE9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
U3KQE9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U3KQE9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U3KQE9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U3KQE9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U3KQE9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
U3KQE9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U3KQE9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U3KQE9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
U3KQE9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
U3KQE9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
U3KQE9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
U3KQE9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
U3KQE9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
U3KQE9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
U3KQE9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
U3KQE9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
U3KQE9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
U3KQE9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
U3KQE9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
U3KQE9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
U3KQE9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
U3KQE9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms