Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A4Q9Y6R1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC4A4Q9Y6R1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A4Q9Y6R1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SLC4A4Q9Y6R1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC4A4Q9Y6R1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms