Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H1

CHCHD2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2Q9Y6H1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHCHD2Q9Y6H1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD2Q9Y6H1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD2Q9Y6H1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD2Q9Y6H1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms