Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPH3AQ9Y2J0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1155.7 ms